La vaquita (Phocoena sinus) fue descubierto en 1958 cuando un individuo se varo el playa en San Felipe, Baja California Norte. En 1980 CEDO comenzó a encontrar vaquitas en las playas de Puerto Peñasco y se generó renovado interés en la comunidad científica. Endémicas del Norte del Golfo de California, hoy la "vaquita" es considerada el cetáceo en mayor peligro de extinción en el mundo. Ha recibido esta distinción cuando el Baji, el delfín del río, chino, se declaró funcionalmente extinto en diciembre de 2006.

A medida que la comunidad científica aprende más acerca de la población de "vaquita", su tamaño, distribución limitada en el norte del Golfo y su alta mortalidad incidental en la pesca con redes agalleras, se llegó a la conclusión de que la mortalidad relacionada con la pesca debe reducirse a cero para la "vaquita" pueda sobrevivir. En 1997, los científicos estimaron que la población de vaquita es de menos de 600 animales, hoy ese número ha disminuido, probablemente con menos de 200 marsopas sobrevivientes.

La creación de la Reserva de la Biosfera Alto Golfo de California y Delta del Río Colorado en 1993 fue un primer paso importante para proteger la vaquita y su hábitat. Ha resultado difícil a restringir la pesca en una zona donde fue durante muchos años la única actividad económica.

En los últimos años hemos aprendido que el 40% de la población de la vaquita se produce fuera de la Reserva, concentrado alrededor de Rocas Consag Island (mapa). La adaptación de la política para adecuarse a estos nuevos descubrimientos llevo a que en 2005 el gobierno creó un nuevo refugio "vaquita" que protege esta zona de mayor abundancia. Esta nueva restricción no ha sido bien acogida por los pescadores, pero ellos se han sumado a un nuevo foro para negociar un futuro mejor para su pesca y la vaquita.

Conocido como Alto Golfo Sustentable (AGS), este nuevo foro involucra a pescadores de las tres comunidades de la Reserva del Alto Golfo, el principal comercializador de camarones del Golfo (Ocean Garden) y las organizaciones no gubernamentales, al igual que CEDO. El grupo ha acordado en tres objetivos básicos: 1) Eliminar la mortalidad de vaquita relacionados con la pesca incidental, 2) mejorar la eficiencia y la sustentabilidad de la pesca del camarón, y 3) eliminar las prácticas pesqueras ilegales.

A continuación se presenta un resumen de las acciones del CEDO y publicaciones que contribuyan a resolver el dilema pesca-vaquita:

1983 - Descubrió y compartió con investigadores Mexicanos los restos de cinco individuos de Phocoena sinus (Magatagan et al. 1983; Maldonado et al. 1984), despertando el interés en la especie.

1988 - Hicimos la primera estimación de la mortalidad de la vaquita por actividades Pesqueras en el Alto Golfo de California, con base en el conocimiento tradicional del pescador (Turk Boyer y Silber 1994).

1992 - Se involucró a los Pescadores de altura en la firma de la declaratoria para la  propuesta de la Reserva Alto Golfo de California y en Reuniones de consenso para el primer plan de manejo.

1994-95 - Participación en el Desarrollo de los primeros Planes de Manejo de la reservas de la Biosfera del Alto Golfo.
- Escribió el componente de educación ambiental para los dos planes de manejo.
- Celebraciones de fechas ambientales conmemorativas, ferias y pláticas diversas en Puerto Peñasco.
- Desarrolló e implementó programas de educación ambiental para las comunidades costeras del Alto Golfo de California (Ver tabla 1 abajo).

1996 - Publicó Voces del Mar, un periódico para difundir información para las comunidades del Alto Golfo de California con un tiraje de 2000 ejemplares (Apéndice 8, 6 ejemplares del periódico).
- Participación en varios esfuerzos de Conservación de la vaquita como el Desarrollo de un Plan Estratégico de Recuperación de la especie, Reuniones de CIRVA (Comité Internacional de Recuperación de la vaquita) y en el subcomité Técnico Consultivo para la Recuperación y Protección de la vaquita marina y de su Hábitat (2005). 

1996-99 - Evaluó las necesidades de maestros del Alto Golfo de California y desarrolló e implementó un Programa de Capacitación (APÉNDICE 7 Juntos Mojemos Nuestros Pies, Maestros).

2001 - 3 Desarrollo talleres con pescadores ribereños del Alto Golfo para involucrarlos directamente en la búsqueda de soluciones para la problemática de la vaquita marina, resultados escritos en el Informe a WWF Turk Boyer & Flores Skydancer, 2002).

2002 - Publicación del librillo "La vaquita del Golfo de California" en inglés y español.
- Desarrollo y publicación de 9200 ejemplares de 3 Números del periódico "Voces del Marzo y del Desierto" Distribuido a las comunidades del Alto Golfo.

2003 - Publicación del libro "vaquita" de actividades y realización un taller para maestros de Peñasco (Apéndice 16)
- Resumen para la consulta pública sobre la actualización del plan de manejo de la Reserva del Alto Golfo de California (Apéndice 17).

2005 y 2006 - Participación en el grupo Alto Golfo Sustentable que estableció el nuevo refugio de "vaquita" con el compromiso de reducir su mortalidad y eliminar la pesca ilegal.